CT prijungimas prie apsauginės relės skiriasi nuo matavimo programų keliais svarbiais būdais. Apsauginėms relėms reikalingi tam tikros tikslumo klasės CT, skirti veikti tiesiškai gedimo metu, kai pirminės srovės gali būti daug kartų didesnės už vardinę vertę. CT antrinis įtaisas turi būti prijungtas prie relės srovės įvesties gnybtų su teisingu poliškumu, kad būtų užtikrintas tinkamas krypties ir diferencialinės apsaugos veikimas.
Antrinės jungtys S1 ir S2 turi būti prijungtos prie relės gnybtų, atitinkamai pažymėtų k ir l grandinės schemoje-. Diferencialinės apsaugos schemose poliškumo suderinimas yra labai svarbus. Sroves, patenkančias į abi saugomos įrangos puses, reikia atsižvelgti į jų kryptį. Kai realiai veikia gedimas, relė turi gebėti atskirti vidinius ir perėjimo gedimus, ir ši atskyrimas visiškai priklauso nuo teisingo CT poliškumo ir prijungimo.
Transformatoriaus diferencialinėje apsaugoje CT prijungimas turi atsižvelgti į fazės poslinkį, kurį sukelia galios transformatoriaus apvijos konfigūracija. Jei pirminė transformatoriaus apvija yra prijungta prie trikampio{1}}, pirminiai CT paprastai prijungiami žvaigždute; jei antrinė transformatoriaus apvija yra prijungta žvaigždute{2}}, antriniai CT jungiami trikampiu. Tai kompensuoja 30 laipsnių fazės poslinkį ir užtikrina, kad į relę patenkančios srovės normaliomis sąlygomis būtų fazinės. Sudėtingesnėse situacijose norint pasiekti reikiamą santykį ir fazių korekciją, gali būti naudojami išoriniai tarpiniai srovės transformatoriai (ICT).
Apsaugos nuo įžeminimo gedimų schemos taip pat priklauso nuo specifinių CT jungčių. Tiesioginis perdavimas gali užtikrinti įžemintos fazės{1}}apsaugą naudojant CT, kurios santykis yra 50/5 arba 10/1. Balansinio srauto relė aptinka įžemintos{6}}fazės srovę, naudodama aplink trijų fazių laidus įtaisytą spurgos-tipo CT, kur srovių suma paprastai turėtų būti lygi nuliui. Liekamosios išjungimo relė naudoja likutinę srovę, gautą iš trijų fazių CT.
Nepriklausomai nuo apsaugos schemos, galioja tos pačios pagrindinės saugos taisyklės: CT antrinė niekada neturi būti atidaryta, kol teka pirminė srovė, o antrinė grandinė turi būti įžeminta viename taške. Prieš prijungiant laidus, antrinis CT turi būti atjungtas-sutrumpinant jį per trumpojo jungimo bloką. Visos išorinės srovės transformatoriaus antrinės apvijos turi būti įžemintos į įžeminimo magistralę ir jokiomis aplinkybėmis CT antrinių apvijų negalima palikti atvirų-, kai teka pirminė srovė. Įdiegę patikrinkite poliškumą, stebėdami relės išmatuotas sroves esant apkrovai arba naudodami fazinį-kampo matuoklį paleidimo metu.